Dive Into the New Age of Accelerated Analytics

Our Services

Проект генотипирования

Направленный на свет химический синтез олигонуклеотидных массивов был проведен компанией . Геномную ДНК амплифицировали методом мультиплексной ПЦР на большом расстоянии, затем все продукты ПЦР, предназначенные для одного массива генотипирования, были объединены вместе и помечены биотинилированными нуклеотидами. Каждый меченый образецов ДНК был гибридизирован с чипом. Гибридизованные чипы промывали, затем инкубировали со стрептавидином, промывали и инкубировали с биотинилированным антителом против стрептавидина с последующей другой промывкой. Затем стружку окрашивали конъюгатом стрептавидин-цихром с последующей промывкой. Гибридизация образца с массивом была обнаружена с помощью конфокального лазерного сканера.

Индивидуальные генотипы для SNP определялись путем кластеризации измерений по нескольким сканированиям в двумерном пространстве, определяемом скорректированными на фоне интенсивности признаков идеального соответствия для эталонных и альтернативных аллелей.

Биочипы

Представляет собой гибридизацию образца нуклеиновой кислоты (мишени) с очень большим набором олигонуклеотидных зондов, которые прикреплены к твердой подложке, для определения последовательности или обнаружения изменений в последовательности или экспрессии гена или для картирования генов (сетка).

Появилось несколько конкурирующих технологий для внедрения зондов на микрочипах. Biotech53 стала пионером в этой области, используя синтезированные на месте олигонуклеотиды в качестве зондов и разработав микрочипы в silico, тем самым устраняя необходимость в управлении библиотеками клонов.

Технология микрочипов имеет два основных применения: анализ экспрессии генов и анализ генетических вариаций.

Фон-исследования

Последовательность ДНК любых двух людей идентична на 99,9 процента. Однако эти различия могут значительно повлиять на риск заболевания у конкретного человека. Участки в последовательности ДНК, где индивидуумы различаются по одному основанию ДНК, называются однонуклеотидными полиморфизмами (SNP). Наборы соседних SNP на одной хромосоме наследуются блоками. Этот шаблон SNP на блоке является гаплотипом. Блоки могут содержать большое количество SNP, но нескольких SNP достаточно, чтобы однозначно идентифицировать гаплотипы в блоке. Гап-карта представляет собой карту этих блоков гаплотипов, и конкретные SNP, идентифицирующие гаплотипы, называются помечайте SNPS.

Hap-карта должна быть ценной за счет сокращения числа SNP, необходимых для изучения всего генома на предмет ассоциации с фенотипом, с 10 миллионов SNP, которые существуют, примерно до 500 000 SNP-меток. Это сделает подходы к сканированию генома для поиска областей с генами, влияющими на заболевания, намного более эффективными и всеобъемлющими, поскольку усилия не будут потрачены впустую, набрав больше SNP, чем необходимо, и все области генома могут быть включены.

We Integrate With Your Ecosystem

Портативный высокопроизводительный нанопоровый секвенатор производства Biotech53, объединяющий в себе секвенирующий блок и управляющую станцию с дисплеем, предназначенный для запуска одной стандартной проточной ячейки R9 или R10.

Главные преимущества

Относится к 3-му поколению NGS-секвенаторов;
Простая и быстрая пробоподготовка без амплификации;
Длинные прочтения без ограничения по длине;
Максимальная производительность до 30 - 45 млрд. нуклеотидов;
Низкая стоимость прочтения одного нуклеотида;
Возможность отслеживать параметры: контролировать процесс секвенирования и проводить бейсколлинг в реальном времени;
Прибор очень легкий (450 г) и компактный (30 х 14 х 11.6 см);
Мобильность: для работы прибора не требуется особого помещения, его можно использовать в «полевых» условиях и перемещать даже во время работы;
Управляющая станция и дисплей зашиты в корпус прибора. Первичная обработка данных может быть произведена в реальном времени с возможностью выгрузки сиквенсов на внешний носитель;
Программное обеспечение работает на ресурсах графического процессора, что ускоряет обработку данных в ~30 раз;
Возможность остановки запуска в любой момент времени.